Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X7

Slco6c1, Solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6c1Q8C0X7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco6c1Q8C0X7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms