Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc2Q8BZW8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc2Q8BZW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms