Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms