Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pggt1bQ8BUY9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pggt1bQ8BUY9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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