Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubr7Q8BU04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms