Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rccd1Q8BTU7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms