Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms