Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik4Q8BMF5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms