Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc2Q8BKV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms