Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prox2Q8BII1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox2Q8BII1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms