Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdca8Q8BHX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms