Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra5Q8BHJ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms