Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmco3Q8BH01 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmco3Q8BH01 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms