Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms