Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms