Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BGC1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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