Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdspl2Q8BG15 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms