Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms