Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Smim19Q80ZU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim19Q80ZU4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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