Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn34b3Q80ZS5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn34b3Q80ZS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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