Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms