Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ttc28Q80XJ3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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