Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Lrrtm4Q80XG9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrtm4Q80XG9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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