Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgef17Q80U35 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arhgef17Q80U35 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms