Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms