Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms