Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms