Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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