Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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