Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfflQ6ZQM0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms