Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms