Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igsf3Q6ZQA6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms