Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssx9Q6XAS3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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