Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rhox8Q6VSS7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rhox8Q6VSS7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rhox8Q6VSS7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rhox8Q6VSS7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms