Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms