Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms