Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms