Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms