Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl2Q6PA06 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms