Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms