Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac10Q6P3E7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms