Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casc4Q6P2L7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms