Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms