Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms