Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Wdr44Q6NVE8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms