Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms