Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms