Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil1Q6EDY6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms