Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbf1Q6DFZ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbf1Q6DFZ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms