Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms